После роковых событий предыдущего фильма Эдди и Веном оказываются в бегах. Все уверены, что именно Брок причастен к гибели детектива Маллигана, а его инопланетный «попутчик» становится целью для Зоны 51. Над операцией работают ведущие умы и элита военных: учёная Тедди Пейн мечтает раскрыть природу симбиота, а Рекс Стрикленд — контролировать его.
Тем временем космическое зло возвращается. Налл, древнее существо и первый симбиот, теряет контроль над своей армией. Чтобы вернуть могущество, он отправляет на Землю ксенофагов — биологических охотников, чья цель — вытащить из Венома Кодекс, скрытый глубоко в его структуре. Но сделать это нужно без вреда для носителя. Пока враги наступают с разных сторон, Брок и Веном пытаются понять: можно ли остаться человеком, когда охота идёт на тебя из двух миров?